1、投资较高与地面灌溉相比，喷灌投资较高，目前半固定式喷灌如不计输变电和人工杂费，一般每亩300~500元，全包括为500~800元。固定式喷灌就更高，有的高达1000亩。2、耗能较大。为了使喷头运转和达到灌水均匀，一定要给水一定压力，除自压喷灌系统外，喷灌系统都需要加压，消耗一定的能源。3、水存留在叶面上容易造成霉菌的繁殖。4、如果灌溉水中有化肥的话，在炎热阳光强烈的天气会造成叶面灼伤。

优点为：1.节水:比传统淹水种植至少节约灌溉水百分之60。2.节肥:由于减少了水的淋洗损失，肥料被作物吸收利用率提高，利用率可提高百分之20，相对提高70百分之以上。3.节约劳动力，简化栽培环节:由于不育秧而采用旱直播，减少了育秧、插秧环节，便于机械化操作，明显提高了劳动生产率。传统栽培1个劳动力管理面积不超过5亩，而水稻1个劳动力可管理至少50亩。

受风和空气湿度影响大当风速在5.5~7.9秒即四级风以上时，能吹散水滴，使灌溉均匀性大大降低，飘移损失也会增大。空气湿度过低时，蒸发损失加大。当风速小于4.5m/s时，蒸发飘移损失小于10％ ；当风速增至9m/s时，损失达30％。我国通过在宁夏、陕西、云南、河南、湖北、北京、福建、新疆等8个省(市)的统一实测，在相对湿度为30％~62％ 、风速0.24~6.39m/s的情况下，喷洒水损失为百分之7到百分之28。

在使用马鞍山育苗微喷头一定要注意一下几点：一、是滴灌的管道和滴头容易堵塞，对水质要求较高，所以要安装过滤器；二、是滴灌投资较高，要考虑作物的经济效益；三、是滴灌不能调节田间小气候，不适宜结冻期灌溉，在蔬菜灌溉中不能利用滴灌系统追施粪肥。有了育苗微喷头工程以后，果农们的负担也减轻了不少呢。